L'association sportive du Cours Saint-François de Sales permet à chaque élève scolarisé dans l'établissement de pouvoir pratiquer une ou plusieurs activité(s) physique(s) en complément de celles programmées dans le cadre des cours obligatoires d'EPS. 

L'association propose des créneaux d'activités physiques et sportives, animés par les enseignants d'EPS dans le gymnase du Cours. 

Tous les vendredis à 13h, les membres du club journal se réunissent pour la rédaction du journal de l'établissement : "Le Petit Saint F." Accompagnés par Madame Grizard dans leurs démarches, ils publient chaque année plusieurs numéros du journal.  

Un intervenant extérieur vient trois fois par semaine dans l'établissement pour proposer aux élèves (à partir du CP) de jouer aux échecs. Débutants ou déjà avancés, les élèves sont accompagnés et guidés pour progresser :

• Le mardi de 11h50 à 12h45 pour le primaire (débutants)
• Le mardi de 13h à 13h55 pour les collégiens
• Le jeudi de 11h50 à 12h45 et de 12h50 à 13h45 pour le primaire (confirmés)

Un club jeux est proposé aux élèves les lundis et jeudis entre 12h10 et 14h. Plusieurs jeux de société sont mis à la disposition des élèves qui peuvent ainsi profiter d'un moment de détente. L'inscription se fait auprès des surveillants.  

Les collégiens et lycéens qui aiment chanter, ou veulent apprendre à chanter sont les bienvenus à la chorale liturgique de l'établissement. Ensemble, ils apprendront des chants polyphoniques. Au fil de l'année, ils les exécuteront pour des concerts spirituels ainsi que pour la représentation annuelle de la Passion.